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软件著作权保护的是源代码还是目标代码？
软件著作权既保护源代码也保护目标代码。
软件著作权保护软件的表达形式，包括程序的源代码和目标代码。源代码是程序员编写的原始程序语句，具有较高的可读性，能清晰地展现软件的逻辑结构和设计思路。目标代码是源代码经过编译后生成的机器可执行代码。
在软件著作权保护中，对源代码和目标代码的保护主要体现在防止他人未经授权的复制、修改、发行等行为。无论是对源代码的直接抄袭，还是对目标代码进行反编译后进行不当使用，都可能构成侵权。
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